邊境牧羊犬近親繁殖學數據圖－Formosa's Elegant Border Collie kennel

4. 近親繁殖

與線結合的祖先的一個小(有效的)數字飼養或近親繁殖可能導致一個高度先天基因庫。圖常用表明相當數量近親繁殖是系數近親繁殖(CI)。 CI與它的父母關係或親屬關係系數是相等的。 CI是可能性從分明個體選擇的隨機二個基因是相同的。一個個體與相等的基因告訴同質接合(為它的染色體的這部分)。

以下慣例，共同地歸因於對Sewel懷特(1922)，用於計算CI狗x用一個簡單的方式：
CI (X) = sum_over_all_common_ancestors_A [{1+CI (A)}/2^N]
那裡N是通過的狗的數量，當追蹤從母親到父親通過共同的祖先A和2^N意味： 2到力量N (2^3 = 2 x 2 x 2 = 8)。

为例採取在表描述的(部份)家譜5。有6個道路通過3個共同的祖先(31154， 82022和88472)，其中CI'S被表明。申請慣例如下：
0.356 = (1+0。422) /2^2 (道路： 88472,154985)
0.178 = (1+0。422) /2^3 (道路： 88472,114559,154985)
0.083 = (1+0。321) /2^4 (道路： 88472,82022,114559,154985)
0.033 = (1+0。046) /2^5 (道路： 88472,31154,82022,114559,154985)
0.016 = (1+0。046) /2^6 (道路： 88472,31154,74933,82022,114559,154985)
0.002 = (1+0。046) /2^9 (道路： 88472,31154,39602等等。)

求和給總CI=66。7%. 五條狗有這樣高CI。它實際上是66。9%由於有些共同的祖先及時促進。這些狗是愛德華・史密斯企圖養殖回到Wiston蓋帽31154。被生產的這五條狗都沒有承受後裔。大衛Rees和Roy Goutte在這些狗寫文章在WSN (參見參考)。這些狗有87。7% Wiston蓋帽的血液在圖2的定義。即使這些圖是100%它不會保證Wiston蓋帽的拷貝，因為它將給它的染色體一個任意混合物。經常這樣飼養導致病症，它在這種情況下，雖然它也明顯地生產了優秀Wiston蓋帽像拷貝。

圖5。家譜例子以高近親繁殖系數。

要計算CI'S所有登記的狗包括所有世代在他們的家譜，我使用Meuwissen快速的算法，并且羅(1992)，根據方法由反過來是亦稱表格方法的Quaas和Henderson提議(1976)。因為多數最近狗有超過一百萬個詞條在他們的家譜，一種快速的算法是需要的。從未超過雖則3000條不同狗，而是不幸地那不減少處理時間。基礎狗認為非先天的(CI=0)。

圖6顯示發生的CI'S作為小狗是出生的年功能。高於有些CI'S 40%站立：

一般幼犬(30670。.30672) 是由J.養殖的。H.1963年Longmire與CI 42。7%. 它是企圖養殖回到他的Flo (10597)。它沒有生產被承受的ISDS登記的後裔。
一件廢棄物與CI=54,5% (130179。.130182) 并且一些與CI=44%歸結於兄弟姐妹交配的幾個世代C.執行的。Winterton在明顯的企圖在1970-1980附近養殖回到Ridgeway幽谷(49029) x Cherryholm薄霧(103055)。它也沒有生產被承受的ISDS登記的後裔。
其他狗與高於CI 40% (38總共)歸結於E。史密斯的企圖養殖Wiston蓋帽(31154)。其中一些狗的基因是存在當前人口。

一條稀薄的線在表6表明平均CI為在一特殊年負擔的所有小狗。狗，在1949在二總結的容量登記了(I和II)之前的Studbooks。他們的CI低歸結於很小數量的祖先在他們的家譜。在平均每個世代5年， 25年是需要的得到完全5部世代家譜。如此家譜可以被認為完全從七十。這片刻與增量的安定的片刻相符在CI的，是因素1。007每年平均在25去年或绝對增量0期間。20-0.25%每個世代(五年期間)。

在1950年之前線能看在CI=25% (和較不清楚在12。5%和6。25%). CI=25%由交配獲得在父母和孩子之間或者在兄弟姐妹之間。在1960年以後這條線在家譜成為隱晦和增加由於更舊的世代的影響。這也是原因為什麼幾乎不所有狗可以近年來發現與CI更低比4%。并且平衡大多數然後來自ROM (登記在優點)狗。

通常，人們會看家譜與6個世代至多。當你只將使用那信息，圖7顯示CI'S。這條線顯示一個越來越少的趨向。區別與一部充分的家譜是7%最大值。如此在短期我們也許是outcrossing比從前，但實際上仍然有增加的近親繁殖。這為閉合的人口是典型的以有選擇性聯接。

10去年CI平均是7%。那是否是高或低的？我有感覺它在低邊與許多其他養殖比較。超過40%將由幾乎大家考慮上流，雖然不不凡在許多其他養殖。在0%附近在10個世代將被認為非常低，并且它是4-5%在時間表尺度的那。大概，因為知道的創建者是先天的他們自己，平均CI一少許更高。

CI 7%一定是低的考慮小遺傳多樣性在當前人口(有效地染色體8條狗)。更多近親繁殖會：